二代健保將於明(102)年1月起上路後，補充保險費將扣取「利息所得」，只要單次利息給付達新台幣2,000元，即須扣繳健保費。對此銀行公會表態認為，門檻過低將墊高銀行成本，完全不符效益，甚至造成民怨。
根據各銀行的資料顯示，國內存款總筆數約1,499萬筆，若是單次給付利息達2,000元，就要扣繳補充保費，銀行的執行成本高達32億元，但是健保補充保費收入才增加30億元，造成稽徵執行成本高於代扣保費收入，完全不符合成本效益。
銀行公會表示，利息所得逾2,000元就要繳保費，民眾為了免遭扣繳補充保費，勢必將原定存進行拆單，並須事先試算免扣繳的存款金額，或分散多家銀行辦理，以降低被扣繳機率，大幅增加民眾及社會負擔。
銀行公會進一步指出，尤其年紀較大的長者或已退休人士，大多以定存為主要投資方式，而且存款屬於獲利較低的投資，若單次給付利息門檻為2,000元，等於是剝奪他們的生活費來源，恐造成民怨四起。
銀行公會更認為，如果主管機關仍維持就源扣繳及低扣費門檻的原則，會讓民眾及銀行付出極大成本，且無法收取到補充健保費，最後淪為三方皆輸。建議扣繳門檻應提高至20,000元，或比照年度申報綜合所得稅方式，一筆總計扣繳年度利息所得，並一次開立扣費憑單，才符合二代健保「抓大放小」的精神。
而且距離明年元旦上路，僅剩下短短的四個月時間，銀行配合調整相關資訊系統及作業，至少須要六個月的時間。銀行公會表示，若倉卒執行，恐造成金融系統的不安定，引發更多的客訴。
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